ＧＩＦＴや体外受精ﾑ胚移植の際の大きな問題点は二つあります。多胎妊娠と卵巣過剰刺激症候群です、多胎妊娠は流早産の頻度を高め、未熟児出産の原因になります。特に三胎（品胎と呼ばれる）以上の場合に、問題が生じやすいのです。卵巣過剰刺激症候群は排卵誘発剤に過剰に反応する結果、卵巣が握り拳以上の大きさに腫大し、腹水や時には胸水が貯留する合併症です。